Le 14 décembre 2020, le Royaume-Uni a signaléune variante préoccupante (VOC) du SARS-CoV-2, lignée B.1.1.7,également appelé VOC 202012/01 ou 20I/501Y.V1.* LeOn estime que la variante B.1.1.7 est apparue en septembre2020 et est rapidement devenu le dominant en circulationVariante du SRAS-CoV-2 en Angleterre (1).B.1.1.7 a étédétecté dans plus de 30 pays, dont les États-Unis.Commedu 13 janvier 2021, environ 76 cas de B.1.1.7 ontété détecté dans 12 États américains.Plusieurs sources de preuvesindiquent que B.1.1.7 est transmis plus efficacement queautres variantes du SARS-CoV-2 (1–3).La trajectoire modélisée decette variante aux États-Unis affiche une croissance rapide au début de 2021,devenant la variante prédominante en mars.AugmentéLa transmission du SRAS-CoV-2 pourrait menacer les soins de santé tendusressources, nécessitent une mise en œuvre étendue et plus rigoureusedes stratégies de santé publique (4), et augmenter le pourcentage deimmunité de la population requise pour le contrôle de la pandémie.Priseles mesures visant à réduire la transmission maintenant peuvent réduire le potentielimpact de B.1.1.7 et laisser un temps critique pour augmenter la vaccinationcouverture.Collectivement, une surveillance génomique amélioréecombiné avec le respect continu des règles publiques efficacesmesures sanitaires, dont la vaccination, la distanciation physique,l'utilisation de masques, l'hygiène des mains, l'isolement et la quarantaine,être essentiel pour limiter la propagation du SRAS-CoV-2, le virusqui cause la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).Stratégiquedépistage des personnes sans symptômes mais à risque plus élevé deinfection, comme ceux exposés au SRAS-CoV-2 ou qui ontcontacts fréquents et inévitables avec le public, fournit un autrepossibilité de limiter la propagation en cours.

Surveillance génomique mondiale et partage open-source rapideing de séquences du génome viral ont facilité le temps quasi réeldétection, comparaison et suivi de l'évolution du SRAS-CoV-2variantes qui peuvent éclairer les efforts de santé publique pour contrôler lapandémie.Alors que certaines mutations du génome viralémergent puis reculent, d'autres pourraient conférer un avantage sélectiftage au variant, y compris une transmissibilité améliorée, de sorte queune telle variante peut rapidement dominer d'autres variantes en circulation.

Au début de la pandémie, des variantes du SRAS-CoV-2 contenantla mutation D614G dans la protéine de pointe (S) qui augmentel'avidité de liaison aux récepteurs est rapidement devenue dominante chez de nombreuxrégions géographiques (5,6).À la fin de l'automne 2020, plusieurs pays ont signalé avoir détectéVariantes du SRAS-CoV-2 qui se propagent plus efficacement.En outreà la variante B.1.1.7, les variantes notables incluent le B.1.351lignée détectée pour la première fois en Afrique du Sud et la lignée récemment identifiéeB.1.1.28 sous-clade (renommée"P.1”) détecté chez quatre voyageursdu Brésil lors d'un dépistage de routine au Haneda (Tokyo)aéroport.§ Ces variantes portent une constellation de muta génétiquetions, y compris dans le domaine de liaison au récepteur de la protéine S,qui est essentiel pour se lier à l'angiotensine de la cellule hôteconvertir le récepteur de l'enzyme-2 (ACE-2) pour faciliter le virusentrée.Les preuves suggèrent que d'autres mutations trouvées dans cesvariantes pourraient conférer non seulement une transmissibilité accrue, maispeut également affecter les performances de certains diagnostics en temps réeltranscription inversée–réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR)dosages¶ et réduire la sensibilité aux anticorps neutralisants(2,3,5–dix).Un rapport de cas récent a documenté le premier cas deRéinfection du SARS-CoV-2 au Brésil avec une variante du SARS-CoV-2qui contenait la mutation E484K,** qui a été démontréepour réduire la neutralisation par les sérums de convalescence et les monoclonauxanticorps (9,10).

Ce rapport se concentre sur l'émergence de la variante B.1.1.7aux Etats-Unis.Au 12 janvier 2021, ni leB.1.351 ni les variantes P.1 n'ont été détectées dans leÉtats-Unis.Pour plus d'informations sur le SRAS-CoV-2 émergentvariantes préoccupantes, CDC maintient une page Web dédiée àfournir des informations sur les variantes émergentes du SRAS-CoV-2.††

 B.1.1.7 lignée (20I/501Y.V1)

Le variant B.1.1.7 porte une mutation dans la protéine S(N501Y) qui affecte la conformation de la liaison aux récepteursdomaine.Cette variante a 13 autres mutations définissant la lignée B.1.1.7 (tableau), dont plusieurs sont dans la protéine S,dont une suppression aux positions 69 et 70 (del69–70) queévolué spontanément dans d'autres variantes du SRAS-CoV-2 et estsupposé augmenter la transmissibilité (2,7).La suppressionaux positions 69 et 70 provoque un échec de la cible du gène S (SGTF)dans au moins une RT-PCR–test de diagnostic basé surTest ThermoFisher Taq Path COVID-19, le B.1.1.7 varifourmi et autres variantes avec le del69–70 produisent un négatifrésultat pour la cible du gène S et un résultat positif pour les deux autrescibles);SGTF a servi de mandataire au Royaume-Unipour identifier les cas B.1.1.7 (1).Plusieurs sources de données indiquent que B.1.1.7 est plusefficacement transmis par rapport aux autres SARS-CoV-2variantes circulant au Royaume-Uni.régions du Royaume-Uni avecune proportion plus élevée de séquences B.1.1.7 avait une épidémie plus rapidecroissance que d'autres domaines, les diagnostics avec SGTF ont augmentéplus rapide que les diagnostics non SGTF dans les mêmes zones, et unune proportion plus élevée de contacts ont été infectés par des patients indexavec des infections B.1.1.7 que par les patients index infectés avecautres variantes (1,3).La variante B.1.1.7 a le potentiel d'augmenter le pan américaintrajectoire démique dans les mois à venir.Pour illustrer cet effet,un modèle compartimenté simple à deux variantes a été développé.La prévalence actuelle aux États-Unis de B.1.1.7 parmi tous lesvirus est inconnu, mais on pense qu'il est inférieur à 0,5 % sur la base de lanombre limité de cas détectés et données SGTF (8).Pourmodèle, les hypothèses initiales comprenaient une prévalence B.1.1.7de 0,5 % parmi toutes les infections, l'immunité au SRAS-CoV-2 deinfection antérieure de 10 %–30%, un reproducteur variable dans le tempsnombre (R t ) de 1,1 (transmission atténuée mais croissante)ou 0,9 (diminution de la transmission) pour les variantes actuelles, et une incidence signalée de 60 cas pour 100 000 personnes par jour le1er janvier 2021. Ces hypothèses ne représentent pas précisémentn'importe quel endroit aux États-Unis, mais indiquent plutôt une généralisation deconditions communes à travers le pays.Le changement de R t surtemps résultant de l'immunité acquise et de l'augmentation de la prévalencelence de B.1.1.7, a été modélisée, avec le B.1.1.7 R t supposéêtre une constante 1,5 fois le R t des variantes actuelles, sur la base deestimations initiales du Royaume-Uni (1,3).Ensuite, l'impact potentiel de la vaccination a été modéliséen supposant que 1 million de doses de vaccin ont été administrées parjour commençant le 1er janvier 2021, et que 95% d'immunitéa été atteint 14 jours après réception de 2 doses.Spécifiquement,l'immunité contre l'infection par les variants actuels ou leLa variante B.1.1.7 a été supposée, bien que l'efficacité etla durée de la protection contre l'infection reste incertaine,parce que ceux-ci n'étaient pas le critère d'évaluation principal des essais cliniquespour les premiers vaccins.Dans ce modèle, la prévalence de B.1.1.7 est initialement faible, mais parce queil est plus transmissible que les variantes actuelles, il présentecroissance rapide début 2021, devenant la variété prédominantefourmi en mars (Figure 1).Que ce soit la transmission du courantvariantes augmente (R initial t = 1,1) ou diminue lentement(R t initial = 0,9) en janvier, B.1.1.7 entraîne un changement substantieldans la trajectoire de transmission et une nouvelle phase de croissance exponentiellecroissance.Avec la vaccination qui protège contre l'infection, leles trajectoires épidémiques précoces ne changent pas et B.1.1.7 se propagentse produit encore (Figure 2).Cependant, après que B.1.1.7 devient levariante dominante, sa transmission a été considérablement réduite.L'effet de la vaccination sur la réduction de la transmission dans le procheterme était le plus élevé dans le scénario dans lequel la transmission étaitdécroît déjà (R t initial = 0,9) (Figure 2).Les premiers efforts quipeut limiter la propagation de la variante B.1.1.7, telle que universelle etrespect accru des stratégies d'atténuation de la santé publique,laissera plus de temps à la vaccination en cours pour atteindre des niveaux plus élevésimmunité au niveau de la population.

Discussion

Actuellement, il n'y a pas de différence connue dans les résultats cliniquesassocié aux variants SARS-CoV-2 décrits ;cependant,un taux de transmission plus élevé conduira à plus de cas, augmentantle nombre total de personnes qui ont besoin de soins cliniques, exacersoulager le fardeau d'un système de santé déjà mis à rude épreuve,et entraînant plus de décès.Surveillance génomique continuepour identifier les cas B.1.1.7, ainsi que l'émergence d'autresvariantes préoccupantes aux États-Unis, est important pour laRéponse de santé publique COVID-19.Alors que les résultats de la SGTFpeut aider à identifier les cas B.1.1.7 potentiels qui peuvent être confirméspar séquençage, identifiant les variants prioritaires qui ne présentent pasLa SGTF s'appuie exclusivement sur la surveillance basée sur les séquences.